世衛組織報告除了禮貌性的讚賞中國防禦工作有進步外，不少篇幅是批評中國政府目前工作的不足。
據中國媒體週四報導重點提及，世界衛生組織總部傳染病執行主任海曼在北京與中國衛生部聯合記者會上說，中國對SARS病人的診斷標準與世界衛生組織的標準是一致的。然而根據CCTV英文版消息，海曼其實表示，目前並沒有一套標準化的病例診斷定義，中國的定義與世界衛生組織的定義只是相容（compatible），而不是說"完全一致"。這一點，世衛的報告中甚至提也不提。
報告中首次披露世衛廣州4月考察的更真實情況，報告說，世衛在4月底視察廣東時，相當關注中國大陸未能及時公布SARS染病個案，並批評了中國政府開始未能把SARS當成危害公眾健康的大事來對待，以致未能及時採取控制其蔓延的舉措。據廣東媒體當時的報導，世界衛生組織認為廣東政府的防禦工作非常到位，對廣東政府的工作大加讚賞，世界衛生組織報告現在才透露情況完全相反。
報告透露，世衛工作小組最為關注，中國大陸缺乏一套第一時間持續跟蹤復發個案的防疫體系，而且在資訊跟進方面也尚未達到世衛的要求，以及大陸在患者如何定義的各自為政的作法可能導致瞞報漏報。由於中國體制、行政上的問題，影響到疾病資料及時共用和分析，尤其是會阻塞省與中央之間的資訊流通。
世衛的報告還表示，世衛組織目前擔心，大量SARS個案無法追溯疫症爆發源頭，因此很難追溯其傳播形式。譬如，北京未接觸過SARS患者感病的個案已從五成上升超過七成。據外電稱，中國的許多地方在診斷SARS患者病例時，如不能確認SARS患者的傳染途徑，就只能作為疑似病例診斷。如果按照世界衛生組織公布的標準進行診斷，這些疑似病例大部分都是屬於確診病例。
在世衛視察期間，中國官員向世界衛生組織官員透露，目前他們相當擔心的是，流感來臨之際難以應對SARS。流感的出現使到SARS的追蹤和確診難度加大，因而大大增加了疑似病例的數位。中國的媒體對於中國官員的這一擔心沒有隻字的報導，據亞洲時報在線記者在廣州醫院瞭解到的情況，廣州的醫院對於前來就診的感冒發燒病人是非常的疏忽大意的。
報告中提到，世衛海曼教授和世衛工作組其他成員，都對中國現在有所行動表示滿意，至少中國對發現SARS會做出及時反應。最近，中國衛生部和世衛共同視察了幾個大陸的某些省份時看到，當地民眾對SARS有高度認知，包括對SARS的症狀以及傳播模式以及每日兩次測體溫等。
世界衛生組織的報告認為，SARS爆發暴露了中國在疾病防疫體系方面的漏洞。中國在衛生基礎設施方面投資常常被忽視，這就為很多不明流行病傳播提供了條件，一旦爆發就極大損害國家經濟。世衛認為，中國大陸防疫體繫在對應新疫症方面需要更加靈活，並加強對應疫症的快速反應能力。
