關於第三隻眼的說法由來已久，在東方的許多宗教儀式上，人們習慣在雙眉之間畫上第三隻眼，認為這樣便可獲得與宇宙進行直接交流的通道。古希臘哲學家認為，第三隻眼位於大腦中心部位，將其比喻為宇宙能量進入人體的閘門。直至今日，現代醫學對第三隻眼的研究也從未停止過。俄羅斯《總結》週刊的一篇文章也對「第三隻眼」作了詳盡報導。
古人類學家別洛夫認為，這一器官在大腦半球下，是一個不大的非對稱器官。「第三隻眼」出現在胚胎髮育兩個月時，即晶體、感光器和間腦區域的神經細胞形成階段。松果體是否是第三隻眼睛，它是否具有特殊功能目前尚無定論。
動物的第三隻眼
紐西蘭的斑點楔齒蜥已經存在了2億年，它的顱骨上有很小的眼眶，在一層透明的膜下隱藏著一隻真正的眼睛。古生物學家發現，許多滅絕的爬行動物頭頂都有眼睛，它是這些動物視覺器官的重要補充。正是因為具有這一獨特的器官，爬行動物才對地震、磁暴和火山爆發等自然災害非常敏感。
動物的第三隻眼確實能夠物盡其用，而且還可以保護自身安全，但人要它來做什麼呢？
第三隻眼的功能
別洛夫認為，先知者眼前出現的畫面，正是松果體作用的結果。大腦將宇宙中的能量彙集起來，而身體與地面振蕩保持一致。所以，松果體能夠從宇宙獲得超凡的想像力，將其化作神經衝動，到達丘腦下部。然後，這些信號隨著神經進入視網膜，視網膜上便出現虛擬的圖像，同時，圖像以神經衝動的形式繼續傳入大腦的視覺皮層，產生意識。未卜先知的畫面通常是閉眼而非睜眼時出現的。
別洛夫認為，祭司充分利用了這一器官。為發揮第三隻眼的功能，他們用鑽石做頭飾，在宗教儀式時佩戴。或許，宇宙的神秘能量正是通過寶石透明剔透的結構，以光束的形式匯聚到頭頂。電磁波到達松果體並作用於其組織，水晶起的作用與晶體類似，只是它吸收的並非普通光線，而是宇宙能量。在宗教儀式上中，祭司正是藉助人為的第三隻眼，洞悉一切。
在舊石器時代末期，一些宗教學說的信徒通常會被施以腦顱環鋸術，他們的頭頂會被挖出不同形狀的洞。環鋸術的被施予者都是祭司的候選人，不知這是不是為了減輕宇宙神秘能量進入松果體的難度。
聖彼得堡的生物學專家對松果體進行了研究。他們發現這種神秘腺體在性成熟前發揮著重要的作用，隨後它的作用形式發生了變化。因此學術界一直認為，它跟闌尾一樣毫無用處。但俄羅斯學者發現它在不同時期都發揮著積極作用。其組成細胞類似視網膜的色素細胞，有能夠分泌激發肌體活性的血清素和具有鎮靜作用的褪黑激素，兩者的分泌量也是相當恆定的。人到了另一個時區作息會失調，身體機能會發生暫時紊亂，正是松果體在搗亂。
古代曾經有能量中心之說，這一中心很早就被冠以第三隻眼之名，因為它能夠接收和反映出具體的圖像，看來古人的結論不無道理。
