其实中共对NGO的公开防范早于2006年。在2005年，安全部下属的中国现代国际关系研究院的一位人员就曾公开撰文指出国际NGO与颜色革命的关系。这一说法明显的被中共高层认可。后来在中国的外国NGO就屡受打压。包括会议被无故取消或所有参加会议的中方人员在开会前两三天纷纷表示“有另外重要事情不能参加”，以及后来发生的“中国发展简报”的主编Nick Young被迫离开中国等等一系列事件。
中共对国际NGO打压的另一个手法是不让你注册。让外国基金会一直处于“非法”状态，可以随时让你走人。所以外国NGO也像中国人民一样，时时刻刻生活在恐惧之中，不知道什么时候就会收到关门的通知。
2004年3月19日，民政部出台了《基金会管理条例》，其中有一项规定是，所有在华的外国基金会必须在2004年12月31日完成注册。当时在华的外国NGO都积极联系，希望自己有一个合法身份。但到目前为止，只有克林顿基金会，盖茨基金会等少数几个获批。其他绝大多数仍处于“非法”状态。