自幼父母雙亡,在臺南廳臺灣府城(今臺南)由經營布料批發店的祖父母照顧之下成長。昭和7年(1932年),22歳的安藤百福以父親的遺產為本錢,經營纖維公司「東洋莫大小」。當時,處理針織品的商社稀少,安藤的事業因此得以擴大規模,昭和8年(1933年)他在大阪設立日東商會。安藤經營針織品貿易、光學機器和精密機械的製造,在公司擴大規模的期間,他同時就讀於立命館大學附屬商專的經濟科。
第二次世界大戰中的空襲炸毀了安藤的事務所和工廠,爾後日本向中華民國政府投降,臺灣出身者需在日本及中華民國之間選擇,為了保有戰前資產,當時的吳百福選擇中華民國國籍,後來1966年才以第三任妻子安藤仁子之姓,歸化日本籍,成為日本公民[3]。安藤轉換事業跑道,開始經營百貨公司和食品事業。昭和23年(1948年)設立中交總社(現在的日清食品),在大阪府南部的海岸上排列鐵板,用倒海水製造鹽的獨特方法進行製鹽事業。